Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPAN13O95857 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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