Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1O43719 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms