Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF3O43395 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms