Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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