Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRTM2O43300 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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