Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLIM4O00461 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLIM4O00461 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms