Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BQV1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BQV1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BQV1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQV1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQV1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQV1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms