Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E9PBE3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E9PBE3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms