Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRRM3A6NNA2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms