Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms