Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms