Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WX78

ELOA3C, Putative elongin-A3 member C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3CA0A087WX78 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELOA3CA0A087WX78 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms