Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WWV3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms