Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113174.1-201ENST00000433897 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006372.3-201ENST00000444158 4049 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFY-204ENST00000449237 3464 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WASH2P-201ENST00000453662 1684 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC017104.1-203ENST00000454416 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL27-203ENST00000503633 742 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNT2-224ENST00000509001 1330 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024581.1-201ENST00000514791 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH3-205ENST00000515241 719 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BIN3-207ENST00000520292 775 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC044810.2-202ENST00000527847 2503 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MOCS1P1-201ENST00000564020 1612 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104758.4-201ENST00000565869 353 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL16-207ENST00000573392 869 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF594-202ENST00000575779 4335 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM95-203ENST00000576060 622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC067819.1-201ENST00000583846 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011466.3-202ENST00000596839 681 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002986.1-203ENST00000602310 330 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355376.2-202ENST00000604686 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB7B-201ENST00000617070 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BPIFA1-204ENST00000618484 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GGNBP1-206ENST00000618642 897 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HS6ST2-206ENST00000640529 831 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAST4-203ENST00000403666 7586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.9 ms