Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MAST4-203ENST00000403666 7586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCTD7-211ENST00000640851 3745 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EYA1-204ENST00000388741 3404 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGA6-207ENST00000458358 3261 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC098679.3-201ENST00000512016 3115 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ACSL6-204ENST00000379244 2658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NBPF6-202ENST00000495380 2494 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CYP27C1-202ENST00000409327 2092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM149A-206ENST00000503432 2011 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RFX6-201ENST00000332958 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FLRT2-204ENST00000554746 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms