Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6I8

PXMP4, Peroxisomal membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP4Q9Y6I8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXMP4Q9Y6I8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms