Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUBP2Q9Y5Y2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUBP2Q9Y5Y2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms