Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRBQ9Y5M8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms