Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GIT1Q9Y2X7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIT1Q9Y2X7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIT1Q9Y2X7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIT1Q9Y2X7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GIT1Q9Y2X7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms