Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1DQ9Y2S0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms