Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POMPQ9Y244 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POMPQ9Y244 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms