Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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