Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms