Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms