Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATPIF1Q9UII2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms