Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms