Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN3Q9P1Z3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms