Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms