Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GIN1Q9NXP7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GIN1Q9NXP7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms