Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COMMD8Q9NX08 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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