Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED17Q9NVC6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms