Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms