Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms