Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms