Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP4Q9NRJ4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms