Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms