Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4BQ9NPR2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms