Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLSTN2Q9H4D0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms