Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMES1Q9C002 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms