Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRIM31Q9BZY9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM31Q9BZY9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms