Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SALL3Q9BXA9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL3Q9BXA9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms