Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP3Q9BWW4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms