Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSBP4Q9BWG4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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