Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDC1Q9BTX1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDC1Q9BTX1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms