Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms