Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SIGMAR1Q99720 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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