Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGMNQ99538 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms