Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHF12Q96QT6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHF12Q96QT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms