Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms