Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC85AQ96PX6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms